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| 第一届电子学与计算机科学系班子成员（1985-1991） | |
| 系主任 | 唐泽圣（清华大学计算机系主任，兼任）,张毓凯（1989-1990） |
| 党支部书记 | 谢树煜（1985-1986），陈良志（1986-） |
| 常务副主任 | 谢树煜（1985-1989，主持工作） |
| 副主任 | 陈良志（1987-1991） |
| 党支部副书记 | 张心生（1985-1986），谢树煜（1986-） |
| 第二届电子学与计算机科学系班子成员（1991-1995) | |
| 系主任 | 陈良志（1991-1995） |
| 党支部书记 | 宋修鼎（1991-1995） |
| 副主任 | 陈守孔（1991-1995） |
| 副主任 | 王延坤（1991-） |
| 党支部副书记 | 王延坤（1991-） |
| 第三届班子成员（1995-1999，计算机科学与工程系；1999-2005，计算机学院） | |
| 系主任（院长） | 陈守孔（1995-2005） |
| 党总支书记 | 宋修鼎（1995-1997），胡辉源（1997-1998），陈守孔（1998-2000），徐远清（2000-2005） |
| 副主任（副院长） | 张伟（1995-2002） |
| 副主任 | 叶苍（1994-1996） |
| 副主任（副院长） | 宋宜斌（1998-2005） |
| 副院长 | 李凯里（1999-2005) |
| 副院长 | 任满杰（2001-2005） |
| 副院长 | 董浩（2001-2006） |
| 党总支副书记 | 刘玉芝（1998-1999），王培进（2001-2005） |
| 第四届计算机学院班子成员（2005-2013） | |
| 院长 | 宋宜斌（2005-2013） |
| 党总支书记 | 王培进（2005-2013） |
| 副院长 | 任满杰（2005-2013） |
| 副院长 | 李凯里（2005-2006） |
| 副院长 | 孙立民（2006-2013） |
| 党总支副书记 | 王少波（2005-2007），王向荣（2010-2013） |
| 第五届计算机与控制工程学院班子成员（2013-2016） | |
| 院长 | 王培进（2013-2016） |
| 党总支书记 | 宋岩（2013-2016） |
| 副院长 | 孙立民（2013-2016） |
| 副院长 | 童向荣（2013-2016） |
| 党总支副书记 | 贺毅（2013-2016） |
